Desarrollo y validación de un test genético preconcepcional mediante secuenciación masiva

Abstract

Este trabajo de fin de grado consiste en el desarrollo y la validación de un test genético preconcepcional para la empresa Bioarray S.L. Por un lado, se ha llevado a cabo la puesta a punto del panel de detección de portadores mediante secuenciación masiva en el equipo Ion Torrent PGM™. El panel incluye 298 genes cuyas mutaciones causan enfermedades recesivas de herencia autosómica y ligada al cromosoma X. Tras la obtención de las secuencias de cinco pacientes, se han empleado herramientas bioinformáticas para detectar las posibles variantes nucleotídicas patogénicas presentes en ellos. También se ha calculado el riesgo residual para la mayoría de los genes del panel, con el fin de comunicar a los pacientes todos los riesgos posibles, cumpliendo así con el consentimiento informado. Por otro lado, como complemento del estudio del genoma, se ha realizado la tradicional técnica del cariotipado en más de veinte pacientes, incluyendo los pacientes secuenciados, para la búsqueda de anomalías cromosómicas que puedan afectar al riesgo reproductivo en una futura gestación de los pacientes, o dicho de otra forma, la probabilidad de tener un descendiente afecto.

This final degree proyect consists in the development and validation of a preconceptional genetic test for the company Bioarray S.L. On the one hand, the development of the carrier detection panel by massive sequencing in the Ion Torrent PGM™ has been carried out. The panel includes 298 genes whose mutations cause recessive autosomic and linked to the X chromosome disorders. After obtaining the sequences of five patients, bioinformatic tools have been used for detecting the possible pathogenic nucleotide variants present in them. The residual risk for the majority of the panel genes has been calculated as well, with the purpose of communicating every possible risk to the patients, accomplishing with the informed consent. On the other hand, as a complement to the study of the genome, the traditional technique of karyotipying has been carried out in more than twenty patients, including the sequenced patients, in order to detect chromosomic anomalies which can affect their reproductive risk in a future pregnancy of the patients, or in other words, the probability of having an affect descendant.