Caracterización de líneas de ADN-T en los genes de la familia LSD1, RABA1c y ABF3 en Arabidopsis thaliana

Abstract

En este Trabajo de Fin de Máster se ha continuado la caracterización fenotípica de 15 líneas de ADN-T en los genes LDL1, LDL2 y LDL3 de la familia LSD1 (LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1), RABA1c (RAB GTPase HOMOLOG A1C) y ABF3 (ABSCISIC ACID RESPONSIVE ELEMENTS-BINDING FACTOR 3) de Arabidopsis thaliana, con objeto de determinar su eventual contribución a la formación de raíces adventicias en el hipocótilo en respuesta a herida. Hemos confirmado la presencia de la inserción de ADN-T en homocigosis en la posición anotada en la base datos en todas las líneas analizadas. Para tres de las líneas estudiadas hemos demostrado que las inserciones de ADN-T afectan a la expresión del gen aguas abajo de la inserción, lo que presuntamente generaría una proteína truncada en su extremo carboxilo. Los estudios fenotípicos indican que los genes LDL1, LDL3 y RABA1c actuarían como reguladores negativos de la formación de raíces adventicias en el hipocótilo en respuesta a herida. Son necesarios estudios adicionales para establecer una relación funcional entre estos tres genes durante la organogénesis de novo.

In this Master Thesis, the phenotypic characterization of 15 T-DNA lines in the LDL1, LDL2 and LDL3 genes of the LSD1 (LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1) family, RABA1c (RAB GTPase HOMOLOG A1C) and ABF3 (ABSCISIC ACID RESPONSIVE ELEMENTS-BINDING FACTOR 3) of Arabidopsis thaliana has been continued, to determine their eventual contribution to adventitious root formation in the hypocotyl in response to injury. We have confirmed the presence of the T-DNA insertion in homozygosis at the position annotated in the database in all the lines analyzed. For three of the lines studied we have shown that T-DNA insertions affected gene expression downstream of the insertion, which presumably would generate truncated proteins at its carboxyl terminus. Phenotypic studies indicate that the LDL1, LDL3 and RABA1c genes would act as negative regulators of adventitious root formation in the hypocotyl in response to wounding. Further studies are needed to establish a functional relationship between these three genes during de novo organogenesis.