Análisis y validación de los perfiles transcriptómicos de variantes histológicas del carcinoma colorrectal

Abstract

El carcinoma tipo serrado (CS) es un subtipo de carcinoma colorrectal (CCR) recientemente reconocido por la OMS. Presenta un fenotipo más agresivo y un peor pronóstico, por lo que es importante disponer de marcadores que nos permitan diagnosticarlo correctamente. Tanto CS como el CCR hMSI-H (con alta inestabilidad de microsatélites y critérios histológicos de MSI-H) han sido propuestos como punto final de la vía del pólipo serrado.Con el fin de valorar las posibles funciones y genes diferenciales en estos dos subtipos histológicos de CCR y buscar marcadores moleculares e histológicos que nos faciliten identificar con que tipo de tumor nos encontramos, se realizaron dos estudios por microarrays de perfiles de expresión génica entre el CS y el adenocarcinoma concencional (CC), y entre CS y CCR hMSI-H. Tras el análisis de los datos se seleccionaron genes diferencialmente expresados para validar su expresión diferencial a nivel de RNAm mediante PCR cuantitativa y a nivel de proteína mediante inmunohistoquímica.Comparado con el CC, el CS presenta expresión diferencial de determinadas funciones como el citoesqueleto y la apoptosis y una desregulación en la función de las TPasas que parece relacionarse significativamente con el desarrollo del CCR de forma general y comportarse de forma distinta entre ambos tipos de CCR. Se ha identificado a Fascina1 e Hipocalcina como marcadores diagnósticos útiles del CS. De la comparacíón de CS con CCR hMSI-H destaca la expresión diferencial de funciones relacionadas con la respuesta inmunológica, que podrían explicar los hallazgos clinicopatológicos observados para el CS en cuanto a la capacidad de éste para evitar el sistema inmune. La mayor expresión de ICAM1 en hMSI-H tumoral podría contribuir al desarrollo de una mejor respuesta inmune en este tipo de tumor