Las herramientas de la metagenómica para conocer mejor nuestra microbiota intestinal y su impacto en la salud

Abstract

La metagenómica ha permitido caracterizar la microbiota intestinal con una precisión antes inalcanzable. Mediante tecnologías de secuenciación como Illumina, es posible identificar cambios en la composición microbiana asociados a distintos estados de salud y enfermedad. Esta revisión sistemática analizó 26 estudios publicados entre 2017 y 2025 que emplearon técnicas metagenómicas (16S rRNA o shotgun) en la plataforma Illumina. Los trabajos incluían poblaciones diversas y abordaban temas como la obesidad, la diabetes, las enfermedades autoinmunes, las infecciones, las intervenciones dietéticas y el uso de probióticos o antibióticos. En general, géneros como Bifidobacterium y Faecalibacterium se asociaron con un perfil intestinal saludable, mientras que otros, vinculados a la inflamación, aparecieron en situaciones de disbiosis. Además, los estudios mostraron que la dieta, los fármacos, el estrés y ciertas intervenciones terapéuticas pueden modificar de manera significativa el microbioma. En conjunto, la metagenómica se confirma como una herramienta clave para comprender el papel del microbioma intestinal en la salud y su potencial para mejorar el diagnóstico y orientar estrategias terapéuticas personalizadas.

Metagenomics has enabled a detailed characterization of the human gut microbiota through high-throughput sequencing technologies such as Illumina. These methods enable the detection of microbial changes associated with different health conditions. This systematic review analyzed 26 studies published between 2017 and 2025 that used metagenomic approaches (16S rRNA or shotgun) on Illumina platforms. The studies involved diverse populations and explored topics including obesity, diabetes, autoimmune diseases, infections, dietary interventions, probiotics, and antibiotic treatments. Overall, genera such as Bifidobacterium and Faecalibacterium were consistently associated with a healthier microbial profile, whereas other taxa related to inflammation were more frequently observed in dysbiosis. The evidence also shows that diet, stress, medications, and therapeutic interventions can significantly modulate the gut microbiome. In summary, metagenomics is a key tool for understanding the relationship between the gut microbiota and health, and it offers promising perspectives for improving diagnosis and guiding personalized therapeutic strategies.