Búsqueda computacional de péptidos para la inhibición de las proteínas AIM2 y ASC del inflamasoma sin afectar a otros mecanismos relacionados

Abstract

LA INFLAMACIÓN ES UNA RESPUESTA COORDINADA DEL SISTEMA INMUNE INNATO PARA FRENAR EL AVANCE DE MICROORGANISMOS PATÓGENOS. ESTÁ DIRIGIDA POR UN MACROCOMPLEJO PEPTÍDICO LLAMADO INFLAMASOMA, CONSTITUIDO A SU VEZ POR FAMILIAS DE PÉPTIDOS QUE INTERACCIONAN ENTRE SÍ. SIN EMBARGO, HAY CONDICIONES EN LAS QUE LA INFLAMACIÓN NO ESTÁ BIEN REGULADA POR EL ORGANISMO, GENERANDO O BIEN UNA INFLAMACIÓN INSUFICIENTE, QUE DERIVA EN UNA INFECCIÓN PERSISTENTE, O BIEN UNA INFLAMACIÓN EXCESIVA, QUE DERIVA EN UNA ENFERMEDAD CRÓNICA O SISTÉMICA. SE HA DESARROLLADO UN TRABAJO DE INVESTIGACIÓN IN SILICO CON EL OBJETIVO DE ENCONTRAR PÉPTIDOS QUE SE UNAN E INHIBAN LAS PROTEÍNAS QUE INICIAN LA FORMACIÓN DEL MACROCOMPLEJO. PARA ELLO, HA SIDO NECESARIO REALIZAR MODELOS DE INTERACCIÓN ENTRE LOS DOMINIOS PYRIN DE ASC Y AIM2 CON ACOPLAMIENTO MOLECULAR, MINIMIZACIÓN MOLECULAR Y MUTAGÉNESIS IN SILICO, Y CON ELLOS ESTUDIAR AQUELLAS REGIONES POR LAS QUE INTERACCIONAN LAS PROTEÍNAS PARA SELECCIONAR Y AISLAR LAS SECUENCIAS PEPTÍDICAS MÁS CONVENIENTES SOBRE LAS QUE CONSTRUIR LIGANDOS. EN TOTAL SE HAN HALLADO 4 LIGANDOS DE LOS CUALES, MEDIANTE MUTACIONES IN SILICO, SE HAN OBTENIDO UN TOTAL DE 1248 PÉPTIDOS MUTADOS. FINALMENTE, SE HAN ESCOGIDO LOS MEJORES Y SE HAN COMPARADO CON LOS LIGANDOS SILVESTRES, COMPROBANDO QUE HAY UN INCREMENTO EN LAS INTERACCIONES HIDROFÓBICAS Y UNA DISMINUCIÓN EN LAS INTERACCIONES ELECTROSTÁTICAS, QUE SE RESUME EN UNA MENOR ESPECIFICIDAD DE LOS LIGANDOS MUTADOS EN COMPARACIÓN CON LOS SILVESTRES Y UNA MAYOR AFINIDAD. CON LOS DATOS GENERADOS SE REALIZARÁ UN TRABAJO DE EXPERIMENTACIÓN IN VITRO PARA COMPROBAR SI LOS PÉPTIDOS GENERADOS SE UNEN A LAS ZONAS DE INTERÉS.