Estudio del resistoma de aislamientos bacterianos en el condado de Turkana (kenia)

Abstract

Introducción: La resistencia a los antimicrobianos (RAM) es una importante amenaza para la salud pública mundial, aunque su incidencia es mayor en regiones menos desarrolladas, como el condado de Turkana en Kenia. El objetivo de este trabajo fue estudiar los mecanismos moleculares implicados en el desarrollo de RAMs en microorganismos aislados en pacientes de Turkana. Materiales y Métodos: Se llevó a cabo un estudio observacional, multicéntrico y prospectivo. En primer lugar, los aislados se identificaron mediante aproximaciones fenotípicas y moleculares y se estudió su sensibilidad antimicrobiana in vitro. A continuación, se secuenció el genoma de cepas seleccionadas y se comparó con la base de datos CARD (Comprehensive Antimicrobial Resistance Database) para obtener el resistoma. Resultados: Se secuenciaron 13 cepas de 8 especies diferentes, revelando 211 genes de resistencia a antimicrobianos (ARGs) diferentes. Los ARGs frente a quinolonas, betalactámicos y tetraciclinas constituyeron más del 45% del total y el 65,35% estaban asociados al eflujo de antibióticos. Finalmente, la correlación entre el genotipo y el fenotipo varió notablemente en función del tipo de antibiótico estudiado. Discusión: Los resultados mostraron una alta presencia de múltiples genes de resistencia, lo que se traduce en un mayor potencial de transferencia génica horizontal a otros patógenos. Sin embargo, para obtener una imagen más precisa y establecer medidas para un uso correcto y eficaz de los antibióticos, es necesario ampliar el número de aislados estudiados.

Introduction: Antimicrobial resistance (AMR) is a significant threat to global public health, although its incidence is higher in less developed regions such as Turkana County in Kenya. The objective of this work was to study the molecular mechanisms involved in the development of AMRs in microorganisms isolated from patients in Turkana. Materials and Methods: A prospective, multicentre, observational study was carried out. Firstly, the isolates were identified through phenotypic and molecular approaches, and their antimicrobial sensitivity was studied in vitro. Next, the genome of selected strains was sequenced and compared with the Comprehensive Antimicrobial Resistance Database (CARD) to obtain the resistome. Results: A total of 13 strains belonging to 8 different species were sequenced, revealing 211 different antimicrobial resistance genes (ARGs). ARGs against quinolones, beta-lactams, and tetracyclines constituted more than 45% of the total and 65.35% were associated with antibiotic efflux. Finally, the correlation between genotype and phenotype varied significantly depending on the type of antibiotic studied. Discussion: The results showed a high presence of multiple resistance genes, which translates into a greater potential for horizontal gene transfer to other pathogens. However, to obtain a more accurate picture and establish measures for the proper and effective use of antibiotics, it is necessary to increase the number of isolates studied.