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Alteraciones transcriptómicas inducidas por clorpirifós en un modelo de celula glial humana


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Title:
Alteraciones transcriptómicas inducidas por clorpirifós en un modelo de celula glial humana
Authors:
Arias Zepeda, Ariel José
Tutor:
Vilanova Gisbert, Eugenio
Sogorb Sánchez, Miguel Ángel
Candela Antón, Héctor
Department:
Departamentos de la UMH::Bioquímica y Biología Molecular
Issue Date:
2019-09
Abstract:
El clorpirifós (CPF) es un plaguicida organofosforotionato (OPT) ampliamente utilizado a nivel mundial como insecticida. Como otros organofosforados (OP), se ha vinculado con efectos tóxicos tanto agudos como crónicos. Aunque se conocen los mecanismos que explican la toxicidad aguda, se sabe poco de los mecanismos moleculares que subyacen a los efectos crónicos. En este trabajo se identificaron las alteraciones transcriptómicas en células de gliobastoma (línea T98G) de origen humano expuestas a CPF. Además, se buscaron productos proteicos capaces de explicar las alteraciones celulares observadas. Mediante un modelo de neuroglía y aplicando tecnologías NGS (Next-Generation Sequencing) para RNAseq, además de herramientas bioinformáticas, se identificaron genes expresados diferencialmente entre las células expuestas a CPF y las células control. El análisis ontológico evid enció una respuesta inflamatoria manifiesta en las células expuestas a CPF. Bajo lenguaje de programación R y el IDE RStudio, se recuperó una lista de proteínas expresadas por las células tratadas susceptibles de ser modificadas por el CPF y por tanto capaces de explicar el inicio y/o la continuidad de las alteraciones celulares observadas. Muchas de estas proteínas estaban relacionadas con los procesos de diferenciación, crecimiento celular y oncogénesis, especialmente en el Sistema Nervioso Central (SNC).
Keywords/Subjects:
RNAseq
transcriptoma
clorpirifós
T98G
bioinformática
ontología
Type of document:
application/pdf
Access rights:
info:eu-repo/semantics/openAccess
Appears in Collections:
TFM-M.U en Biotecnología y Bioingeniería



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